- Sub Bagian Administrasi dan Umum
- Tim Kerja 1 (Surveilans dan Penindakan Pelanggaran Kekarantinaan Kesehatan)
- Tim Kerja 2 (Pengawasan Faktor Risiko Kesehatan Alat Angkut dan Barang)
- Tim Kerja 3 (Pengawasan Faktor Risiko Kesehatan Lingkungan)
- Tim Kerja 4 (Pengawasan Faktor Risiko Kesehatan Orang, Kegawat Daruratan dan Situasi Khusus)
- Tim Kerja 5 (Layanan Publik dan Zona Integritas)

